Karte erstellt mit QGIS

An diesen Stellen haben die Schülerinnen und Schüler des BORG Nonntal und des BRG Schloss Wagrain im November 2022 Wasserproben gesammelt. In den bezeichneten und rot markierten Gewässern haben wir Aquirufa nachgewiesen. Wir haben auch einige Aquirufa Bakterienstämme aus den im Klassenzimmer angelegten Kulturen erhalten. Jetzt hoffen wir, dass auch neue, bis jetzt unentdeckte Arten dabei sind.

Im Labor haben sich nun aus der Mitarbeit der ersten beiden Klassen (BORG Nonntal und BRG Schloss Wagrain) eine ganze Menge Bakterienstämme in Form von Kulturen angesammelt. Sie wachsen jetzt nicht nur auf Agarplatten, sondern auch in flüssigem Medium. Mit Hilfe von PCR (Polymerasekettenreaktion) und Sequenzierung von kurzen Abschnitten der DNA (Erbsubstanz) konnten davon über 25 Stämme der von uns gesuchten Gattung Aquirufa zugeordnet werden. Von 43 gesammelten Wasserproben konnten die Schüler/innen mit dem Projektteam aus 13 Proben Bakterienstämme der Gattung Aquirufa isolieren. Das sind ca. 30 % der Wasserproben und dieser hohe Anteil hat das Projektteam doch ziemlich überrrascht. Er bestätigt, dass es sich um eine weitverbreitete Bakteriengruppe handelt. Und das sind die 13 Gewässer bzw. Wasserproben: Leopoldskroner Weiher LEOWEIH-7 (Edna Jahija) und LEPPI-3 (Ioanna Polo), WALLSEE-11 (Wallersee, Laura Kaltenbrunner), FUSSEE-8, (Fuschlsee, Christina Rieger), WAEICH-18 (ein namenloser Waldtümpel, Martin Windberger), GLASBACH-12 (Glasbach, Mona Lechner), MRZGBC-6 (Morzger Bach, Nadine Pernsteiner), BHBGOP-31 (Bach bei Gopprechting, Hannah Stockinger), GARBAGER-33 (Gartenteich, Julia Schiller), BABACH-43 (Bach bei Bach 😉 Martha Wohlschläger), AGERTUE-44 (Ager Tümpel, Ronja Hauser), WATS-35 (Waldtümpel Schönberg, Kilian Ponget) und DARE-47 (Wasser aus Dachrinne, Sonia Qaiser). Von 11 der isolierten Bakterienstämme werden wir das ganze Genom sequenzieren lassen, da sich erst damit sicher sagen lässt, bei welchen es sich um neue Arten handelt. Diese stammen aus: WALLSEE, LEOWEIH, LEPPI, FUSSEE (falls der Stamm kooperiert 😉 ), WAEICH, DARE, WATS, BHBGOP, BABACH und GARBAGER.

Die Schüler/innen vom BORG Nonntal und BRG Schloss Wagrain hatten mitgebrachte Wasserproben von unterschiedlichen Gewässern bearbeitet und auf Agarplatten ausgestrichen. Wie man auf den Fotos sieht war nach zwei Wochen schon einiges darauf gewachsen.
Im Labor haben wir dann die vielversprechenden Kolonien mit dem typischen ‚Aquirufa-Rot‘ ausgewählt und in flüssiges Medium gebracht. Diese Flüssigkulturen haben wir dann wieder auf Agarplatten ausgestrichen. Ein paar davon sieht man auf den Fotos:

Am 23. November waren wir (Alexandra, Johanna und Stefan) zum zweiten Mal am BRG Schloss Wagrain zu Gast. Diesmal klappte die Anreise reibungslos und wir machten es uns noch für eine Weile vor dem Biosaal gemütlich.
Dann ging es endlich los. Zuerst gab es eine Einführung zum Thema Bakterien, was sie sind und ihre Bedeutung für die Umwelt und für uns. Die Schüler/innen wussten schon eine ganze Menge zum Thema und konnten einiges beitragen. Anschließend wurden zwei Gruppen gebildet und abwechselnd die Agarplatten vom letzten Workshop angeschaut und die mitgebrachten Proben bearbeitet. Bei den meisten Schüler/innen bestätigten sich die Vermutungen zu den Proben vom letzten Workshop. Auf den Agarplatten mit Trinkwasser war einiges an Bakterienkolonien zu entdecken. Das hat so schon seine Richtigkeit, im Trinkwasser sind Bakterien und dürfen da auch sein. Nachdem die Schüler/innen im Vortrag erfahren hatten, dass jeder von uns ca. 1,5 kg Bakterien mit sich herumträgt, ist das auch nicht weiter erstaunlich. Auf Agarplatten, auf die Desinfektionsmittel aufgetragen wurde, waren dagegen kaum Bakterienkolonien zu entdecken. Wir hatten auch Agarplatten offen im Klassenzimmer ausgelegt, da gab es einige Schimmelkolonien und schön gefärbte Kolonien von Luftkeimen zu bewundern. Das Bearbeiten der mitgebrachten Wasserproben ging dann dank der Übung im ersten Workshop recht gut. Wir sind gespannt, was auf den Agarplatten wachsen wird. Hier im Blog gibt es bald Neuigkeiten dazu. Wir freuen uns auf ein Wiedersehen mit der Klasse im nächsten Jahr 🙂 .

Am 16. November waren wir (Alexandra, Johanna und Stefan) wieder am BORG Nonntal bei der 6c zu Gast. Zuerst einmal gab es einen Vortrag über Bakterien und ihre Bedeutung für die Ökosysteme und für uns. Die Schüler/innen wussten schon eine ganze Menge zum Thema, das hat uns sehr gefreut. Wir konnten hoffentlich zeigen, welche enorme Vielfalt in der Welt der Bakterien existiert und dass die uns umgebenden Pflanzen und Tiere nur einen sehr kleinen Teil der Lebeswesen auf der Erde darstellen.
Gemeinsam haben wir uns dann die Agarplatten vom ersten Workshop angeschaut. Die Schüler/innen hatten ja eine Flüssigkeit, in der sie viele Bakterien vermuten und eine mit wenig auf Agarplatten ausgestrichen. Da gab es erstaunliche Entdeckungen. Auf mehreren Agarplatten mit frisch abgekochtem Wasser konnten wir keine Bakterienkolonien entdecken. Dafür waren auf Platten mit destilliertem Wasser, das schon länger geöffnet aufbewahrt wurde, einiges an Bakterienkolonien gewachsen. Aus Wodka konnten wir auf unseren Platten nichts kultivieren. Der ‚Handyabklatsch‘ ging etwas schief (Platten nie ohne Parafilm aufbewahren 😉 ), aber Bakterien sind wohl auf den Handys reichlich vorhanden, das konnten wir feststellen. Wir hatten im 1. Workshop auch ein paar Agarplatten einige Minuten geöffnet im Klassenzimmer ausgelegt. Dort konnte man schön gefärbte Kolonien von Luftkeimen und einige Schimmelkolonien bewundern.
Dann kamen wir zum wichtigsten Teil, dem Filtrieren und Ausstreichen der mitgebrachten Wasserproben. Das ging nun wirklich sehr gut, da hatte sich die Übung aus dem vorherigen Workshop bezahlt gemacht. Wir sind sehr gespannt darauf, was auf den Platten so wächst. Die ausgewählten Gewässer sehen auf alle Fälle sehr interessant aus.
Wir freuen uns schon auf das nächste Treffen mit dieser tollen Klasse vom BORG Nonntal 🙂

Am 9. November waren wir (Alexandra, Johanna, Ulli und Stefan) zu Besuch am BRG Schloss Wagrain. Da die dortige Klasse 5b recht gross ist, hatte uns Ulli, die auch im letzten Projekt bei den Workshops dabei war, begleitet. Nachdem wir Vöcklabruck etwas unfreiwillig mit dem Auto erkundet hatten, kamen wir gerade noch rechtzeitig in der Schule an. Der Workshop mit der sehr netten Klasse fand im Biologiesaal statt, da gab es einige lebende Tiere zu bestaunen. Zuerst gab es wieder eine theoretische Einführung und dann wurden die mitgebrachten Proben bearbeitet. Auf Agarplatten wurden Proben ausgestrichen, in denen Bakterien zu erwarten sind und solche, in denen sich eher weniger Bakterien befinden sollten. Dann wurde noch pH Wert und Leitfähigkeit gemessen. Die Schüelr/innen sollten nun genug praktische Erfahrungen gesammelt haben, damit mit den eigentlichen Wasserproben in zwei Wochen alles reibungslos funktioniert. Das Wetter ist ja noch sehr schön und so sollte Gelegenheit sein, ein geeignetes Gewässer auszusuchen. Wir sind schon sehr gespannt auf die Wasserproben und darauf, was auf den Agarplatten so alle gewachsen ist und freuen uns auf den nächsten Workshop.

Am 7. November haben wir (Alexandra, Johanna und Stefan) uns zu unserem allerersten Workshop im Projekt aufgemacht. Begleitet wurden wir von unserer ‚Instagram Beauftragten‘ Sabrina. Unser Ziel war das BORG Nonntal und die dortige 6. Klasse des naturwissenschaftlichen Zweiges. Zuerst gab es eine Einführung in das Projekt. Dann wurden die mitgebrachten Proben auf Agarplatten ausgestrichen. Jede/r hatte eine Flüssigkeit mitgebracht in der Bakterien vermutet werden und eine mit vermutlich wenigen Bakterien. Das mikrobiologische Arbeiten klappte recht gut, im Umgang mit der Laborpipette waren die Schüler/innen schon geübt. Dann wurde noch der pH Wert und die Leitfähigkeit in den mitgebrachten Proben und weitere Proben gemessen. Die Tatsache, dass Wodka eine sehr geringe Leitfähigkeit hat, rief Erstaunen hervor. Weniger erstaunlich war, dass er sich nach getaner Arbeit sehr gut zum Tische putzen eignet. Jetzt sind wir sehr gespannt, ob sich aus Wodka auf Agarplatte Bakterienkolonien züchten lassen. Sehr spannend wird auch, was sich auf den Agarplatten des Lehrers und der Lehrerin mit einem ‚Handyabklatsch‘ so getan hat. Im nächsten Workshop werden wir es erfahren. Die Schüler/innen bekamen ausserdem die Aufgabe aus einem selbstgewählten Gewässer eine Probe mitzubringen. Die werden wir dann im nächsten Workshop bearbeiten. Wir hoffen, dass möglichst unterschiedliche Gewässer beprobt werden und vor allem, dass das Datenblatt dazu gewissenhaft ausgefüllt wird. Die Daten brauchen wir nämlich, damit wir die aus den Proben gezüchteten Bakterienstämme auch wirklich für unsere Forschung verwenden können. Am 16. November geht es dann weiter, wir sind auf alle Fälle schon gespannt.

Wir sind jetzt auch auf Instagram. Dort kann unser neues Sparkling Science Projekt verfolgt werden.

Am 10. Oktober haben wir unser neues Citizen Science Projekt Aquirufa: Biodiversität und Ökologie von Süßwasserbakterien mit einer Kick-off Veranstaltung am Forschungsinstitut für Limnologie in Mondsee gestartet. Die beteiligten Lehrer/innen von den Partnerschulen wurden zunächst mit einem Vortrag über das Projekt informiert. Dann wurde unser Labor besichtigt und unsere Kulturen auf dem Schüttler konnten bewundert werden. Nach einem Rundgang durch das Molekularbiologielabor ging es anschließend in den Kühlraum. Dort sind hunderte (oder tausende?) Bakterienstämme bei minus 80 °C in einem Art Winterschlaf, bis sie von uns oder anderen Wissenschaftlern benötigt und wieder aufgetaut werden. Zum Ausklang gab es eine kleine Stärkung im Seminarraum vor der Kulisse der Drachenwand im Abendlicht. Wir sind schon sehr gespannt auf die Workshops mit den Schulklassen, die im November beginnen werden 🙂 .
Das Team in Mondsee (Alexandra Pitt, Johanna Schmidt, Stefan Lienbacher und Martin Hahn)

Wir freuen und sehr, dass unser Projekt Aquirufa: Biodiversität und Ökolgie von Süßwasserbakterien bei der der 1. Ausschreibung von Sparkling Science 2.0 bewilligt wurde. Am 1. September 2022 geht es los. Dann werden wir mit sechs Schulklassen und weiteren Citizen Scientists eine wichtige Bakteriengruppe in unseren heimischen Gewässern erforschen.

Im Juni 2022 ist eine weitere Beschreibung von zwei neuen Arten, die zur Gattung Aquirufa gehören, in der Zeitschrift Archives of Microbiology erschienen: Aquirufa lenticrescens sp. nov. and Aquirufa aurantiipilula sp. nov.: two new species of a lineage of widespread freshwater bacteria
Der Artikel ist frei verfügbar und kann hier als pdf heruntergeladen werden: https://link.springer.com/article/10.1007/s00203-022-02950-6
Mehrere Sommerpraktikant/innen haben daran mitgearbeitet und sind in der Danksagung gewürdigt:
We are grateful to Ingrid Lugstein and Noah Bruckner for their assistance in water sampling and laboratory work. We are also grateful to Jana Mierl and Lea Huemer for assistance in water sampling and data analyses.
Die beschriebenen Bakterienstämme hat Sophia Krausz entdeckt und isoliert. Da sie außerdem in zwei Sommerpraktika intensiv an der Charakterisierung im Labor mitgearbeitet hat, fanden wir, dass sie als Coautorin bei der Veröffentlichung dabei sein muss. Herzlichen Glückwunsch Sophia!

Die beiden Praktikantinnen Jana und Lea waren in ihrem FFG Praktikum im Sommer 2021 sehr fleissig. Sie haben Wasserproben von verschiedenen Gewässern genommen und geschaut, ob sie daraus interessante Bakterien kultivieren können. Dazu haben sie von ihren Kulturen die DNA (Erbsubstanz) isoliert, PCR (das bedeutet das Vervielfältigen der DNA) von einem kleinen Abschnitt der DNA gemacht und die Proben zum Sequenzieren weggeschickt. Die erhaltenen Sequenzdaten haben sie analysiert und dabei festgestellt, dass sie von unserer Lieblingsbakteriengattung 😀 Aquirufa neue Bakterienstämme entdeckt haben. Aber ganz besonders spannend war die Entdeckung von zwei neuen Bakterienarten, die wahrscheinlich auch zwei neue Gattungen sowie Familien repräsentieren. Das hat die Arbeitsgruppe sehr gefreut 🙂 .

Montags nahmen wir Proben am Irrsee, dem Iltisbach und der Zeller Arche, die wir am selben Tag noch auf Agarplatten ausgestrichen haben. Außerdem haben wir die Trübung der Proben mit dem Photometer gemessen. Am Dienstag haben wir Medium gekocht und dann Platten gegossen. Mit Johanna machten wir mit unseren Proben PCR. Mittwochs werteten wir unsere Platten aus und gaben es in das zuvor gemachte Flüssigmedium. Am Donnerstag tropften wir Bakterien von den Wellplatten auf eine Agarplatte und am Freitag machten wir Verdünnungsreihen und strichen sie auf Platten aus. Jana & Lea

Unser erster Arbeitstag begann mit einer Führung durch das Gebäude und der Einführung in die Laborregeln. Danach durften wir Nährmedium herstellen und es zum autoklavieren vorbereiten. Am Dienstag fuhren wir zum Großen Egelsee um dort Proben zu nehmen. Bei der Heimfahrt nahmen wir auch noch von einem kleinen Tümpel und einem Bach im Wald eine Probe. Wir ermittelten den pH-Wert, die Leitfähigkeit und die Temperaturen der Proben und legten Platten an um später, die darauf wachsenden Kulturen untersuchen zu können. Am Mittwoch suchten wir auf Google Maps die genauen Koordinaten der Probennahmen, um diese dokumentieren zu können. Außerdem gossen wir, aus dem am Vortag gekochten Medium, Platten. Am Donnerstag bereiteten wir das Medium selbstständig zu und auch alltägliche Aufgaben wie Spülen wurden von uns erledigt. (Jana & Lea)

              

Unter dem Titel Prokaryotic names: the bold and the beautiful (FEMS Microbiology Letters, Volume 367, Issue 17, September 2020, fnaa096, https://doi.org/10.1093/femsle/fnaa096) ist ein Artikel von Aharon Oren erschienen. Darin werden besondere Artnamen für Bakterien gewürdigt. Eine Überrraschung für uns war, dass darin der von den Schülerinnen Eva Schnitzlbaumer, Carina Schiel, Gerhild Bach, Valentina Gruber, Lena Roider, Lena Beitscheck and Sarah Jelovcan vom Bundesrealgymnasium Seekirchen kreierte Artname Aquirufa nivalisilvae als besonders schön und interessant hevorgehoben wird. Das Artepitheton nivalisilvae bezieht sich dabei auf die Herkunft des Stammes aus einem Waldtümpel in Schneegattern. Das hat uns sehr gefreut und wir gratulieren den jungen Forscherinnen ganz herzlich dazu 🙂